全球首部:《中国肺癌杂志》发布非小细胞肺癌DNA+RNA同步共检专家共识
- 2023-11-29 14:11:40
- 快讯
2023年11月,《基于RNA-based NGS检测非小细胞肺癌融合基因临床实践中国专家共识》(以下简称《共识》)正式见刊《中国肺癌杂志》。该共识由中国初级卫生保健基金会肿瘤精准诊疗专业委员会等学会发起,上海交通大学附属胸科医院韩宝惠教授、北京大学肿瘤医院林冬梅教授、四川大学华西医院周清华教授、东部战区总医院宋勇教授、复旦大学附属肿瘤医院周晓燕教授和广东省人民医院肿瘤医院周清教授共同担任编撰指导专家,上海交通大学附属胸科医院钟华教授执笔,60余位来自全国各地临床病理专家共同进行讨论、修改、投票和定稿,思路迪科技(上海)有限公司在数据和资料收集的过程中提供帮助,制定了这部在国内外指南共识中首次推荐采用DNA联合RNA共同检测非小细胞肺癌驱动基因的专家共识。
近两三年来已有不少的DNA联合RNA检测融合的技术和产品在临床上开展应用,但由于这些技术和产品大多数是对肿瘤样本独立平行进行DNA和RNA测序,检测费用较高,对样本要求也高,因此未能广泛推广使用。目前,DNA-based NGS结合RNA-based NGS一次性同步检测基因突变和融合的技术已经研发成功,并开始应用于临床实践,但我国仍缺乏RNA-based NGS检测融合基因的应用时机、应用场景和质控方面的规范和标准。
本期访谈特别邀请到本共识的五位发起专家,针对《共识》内容进行深度访谈。五位发起人将分别就发起《共识》的初衷、《共识》与已发布同类共识的区别、《共识》的一次性同步检测DNA和RNA的技术和目前市面上已有的DNA+RNA检测的差异、以及其它在《共识》中提及的临床或病理相关内容等问题进行解答。
作为全球首部非小细胞肺癌DNA+RNA共检共识的发起者,韩宝惠教授在提及发起本《共识》的初衷时道:“利用国内创新检测技术,让携带融合基因变异的非小细胞肺癌患者实现更准确、更及时的融合变异检测,并且不增加额外的检测成本和样本数量,让大多数肺癌患者都可支付高性能的检测,是我们做这个共识的最大初衷。”
谈及本《共识》与已发布的融合变异检测相关的共识相比有哪些差异,且为何说本《共识》是全球首部非小细胞肺癌DNA+RNA同步共检的专家共识时,韩宝惠教授言:“本共识与已发布共识主要有三大差别。首先,本共识聚焦在RNA-based NGS检测非小细胞肺癌的融合基因。其次,本《共识》的一大亮点是建议有条件的医疗机构,对一份样本一次性利用DNA-based NGS检测点突变或插入缺失突变,同步利用RNA-based NGS检测基因融合变异,可以称之为“同步共检”或“一管双检”。此外,组织标本是否足够,患者的经济负担等,也都是我们需要考虑的因素。本《共识》倡导一次性实现DNA+RNA检测,而不是将RNA作为DNA检测的补充手段,这是中国专家在世界范围内首次提出的,所以说是‘ 全球首部非小细胞肺癌DNA+RNA同步共检的专家共识’。最后,本共识强调了利用FFPE样本就可实现RNA-based NGS检测融合基因,肯定了FFPE样本经质控评估合格后可用于RNA-based NGS检测融合基因的应用价值。”
林冬梅教授在“一次性同步检测肿瘤组织样本的DNA和RNA无疑是一个重要的技术突破,您觉得这样的创新技术对非小细胞肺癌分子诊断会带来什么样的影响?”问题中回答道:“目前国内DNA+RNA技术参差不齐,比较常见的是分开进行DNA-NGS和RNA-NGS检测的技术手段,最新的“一管双检”技术能够在低RNA投入量且不增加样本量、时间成本和经济成本的情况下,实现一次性同步检测肿瘤组织样本的DNA和RNA,无疑是给我们国内的患者带来了更强大、性价比更高的检测方案,也能促进肿瘤精准诊疗的进一步发展。我个人认为,DNA+RNA同管共检会是今后初诊晚期非小细胞肺癌患者基因测序的大趋势和大方向。”
针对本《共识》的一次性同步检测DNA和RNA的技术,和目前国内已有的DNA+RNA检测的区别,周清华教授认为:“前DNA+RNA的检测策略可以分为三类:一类可以称之为“联合法”,实质上是取了患者肿瘤组织后,分别对DNA和RNA进行抽提、建库和测序,二者平行且独立检测,最终同时出具DNA+RNA的检测结果,但这样的检测策略对费用要求高,对样本要求也高,目前临床上仅有价格较高的大Panel才能提供,大部分患者无法负担;第二类是 “序贯法”,这也是此前多个指南共识推荐的检测策略,这个策略虽然明显优于“联合法”,但其实质仍然是DNA和RNA分开的检测,并不是真正的技术突破;第三类是“同步法”,即实现DNA+RNA抽提后,在同一个反应体系里面进行建库、测序、数据分析,这是以技术的突破和创新为前提的检测策略,带来的好处是并未增加对费用和样本的要求,在小panel上也可以实现DNA+RNA的检测,大部分患者都可以负担,因此具备在临床上广泛应用的潜力。本共识所倡导的一次性同步检测DNA和RNA,即是指可以实现第三类“同步法”的检测技术,这无疑也将成为未来的检测趋势。”
此外,两位发起人周晓燕教授以及周清教授也针对本《共识》,结合临床实际发表了自己的观点,阐述了RNA-based NGS为何比DNA--based NGS检测更有优势、用RNA 检测融合有哪些需要考虑的质控参数并如何保障检测的准确性等问题的看法。
作为全球首部非小细胞肺癌DNA+RNA同步共检专家共识,本《共识》将进一步明确RNA-based NGS在融合基因检测中的应用时机、应用场景和质控,并给予指导性建议,同时推动DNA-based NGS结合RNA-based NGS一次性同步检测在非小细胞肺癌临床诊疗中的应用,使患者能够最大程度地从融合基因检测中获益。
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