医院设有内一科（心血管、消化）、内二科（神经内科）、呼吸与危重症医学科、肾内科（血液透析）、氧疗科（富氧室、高压氧科）、综合内科（肿瘤治疗中心）、、外一科（普外、泌尿、肿瘤、胸外）、外二科（神经、骨科）、妇科、产科、儿科、五官科、眼科、耳鼻喉科、口腔科、皮肤科、中蒙医康复科、心理咨询门诊、重症监护（ICU）、介入科、感染科麻醉手术科、门诊处置室、120急救站、内窥镜室、急诊科、CT/MRI室、超声科、放射科、输血科、检验科、病理科、功能科、药剂科、西药房、中药房、心电图室、体检科等临床科室和医技科室。

鄂尔多斯市重点学科：妇科、产科、手术麻醉科、心血管内科、神经内科、普外科。

一、优势病种：宫颈肿瘤、子宫肿瘤、卵巢恶性肿瘤、阴道疤痕、滋养细胞肿瘤、输卵管肿瘤、盆腔器官脱垂、脑血管病、脊髓血管病、中枢神经系统感染疾病、癫痫、眩晕症、肌病、周围神经病、抑郁症、神经衰弱、糖尿病、甲状腺疾病、慢性支气管炎、慢性阻塞性肺病、肺心病、支气管哮喘、肺炎、肺结核、肺癌、肺栓塞、部分肺间质疾病、呼吸衰竭、胸膜疾病、睡眠呼吸暂停综合征、变态反应性疾病、肺癌、乳腺癌、食管癌、胃癌、大肠癌、恶性淋巴瘤、头颈部肿瘤、贫血、白血病、血小板疾病、类风湿性关节炎、强制性脊柱炎、系统性红斑狼疮。

二、优势技术：腹腔镜下子宫次全切除术、筋膜内子宫切除术、子宫肌瘤剔除术、卵巢囊肿剔除或切除术、宫外孕病灶切除术、阴道口狭窄手术、阴道肿瘤手术、输卵管复通术、生殖器官先天发育异常手术、张力性尿失禁矫治手术、腹腔镜上消化道穿孔修补术、腹腔镜下胆囊切除术、腹腔镜下阑尾切除术、腹腔镜下直肠癌根治术、腹腔镜下脾切除术、腹腔镜下肾上腺及肾脏手术、后腹腔镜下肾脏切除术、肾囊肿开窗引流术、膀胱镜下膀胱肿瘤局部切除术、经尿道前列腺等离子电切术、食管癌根治术、肺切除术、肺修补、人工髋关节置换术、人工膝关节置换术、腰椎管狭窄后路减压-椎体融合术、膝关节韧带损伤关节镜下重建术、腰椎骨折钉棒系统复位固定术、骨盆/髋臼骨折的前后路手术、复杂的四肢骨折手术治疗、手外科神经、肌腱断裂的早期修复、四肢骨骼软组织肿瘤手术、周围神经损伤治疗、颅内血肿清除术、颅内肿瘤切除术、脑积水脑室-腹腔引流术。