医院设有心血管/内分泌/风湿免疫科、肿瘤内科、呼吸与危重症医学科、消化内科、神经内科、普外科、胸外科、骨外科、泌尿外科、神经外科、妇科、产科、儿科、眼耳鼻喉科、口腔科、感染性疾病科、急诊科、手术麻醉科、中医科、体检科、疼痛科、检验科、康复医学科、药剂科、介入导管室、放射科、超声科、病理科等临床科室和医技科室。

一、呼伦贝尔市临床医学重点学科：消化内科学、临床检验学、肿瘤内科学、急诊急救医学、临床输血医学。

二、呼伦贝尔市临床医学重点专科：骨外科学、泌尿外科学、神经内科学。

三、满洲里市重点专科：心血管内科、肾脏内科、神经内科、普外/胸外科、妇科、口腔科。

四、满洲里市重点学科：心血管内科、消化内科。

一、优势病种：四肢关节结核、急/慢性骨髓炎、乳腺癌、肺癌、食管癌、结直肠癌、胃癌、淋巴瘤、骨髓瘤、肝癌、肾癌、高血压脑病、急慢性脑血管疾病、头晕、头痛、癫痫、中枢神经系统感染性疾病、脱髓鞘疾病、神经心理疾病、急性一氧化碳及其他气体中毒、神经性耳鸣、突发性耳聋、动脉硬化闭塞症、大隐静脉曲张、下肢深静脉血栓、混合痔、直肠粘膜脱垂、妇科炎症、妇科肿瘤、异常子宫出血、不孕症、牙体牙髓病、牙周病、儿童牙病、口腔粘膜病。

二、优势技术：闭合或开放性四肢长骨骨折的手术治疗、软组织缺损皮瓣转移修复术、骨肿瘤切除以及保肢手术、断肢再植以及神经血管损伤断裂修复术、儿童先天性畸形矫形术、腰椎骨折切开复位减压钉棒内固定术、腰间盘脱出症的保守以及手术治疗、经皮穿刺椎体后突成型术、人工全膝/全髋关节置换术、肾囊肿去顶减压术、无功能肾切除、电切镜经尿道前列腺电切术、输尿管中下段结石气压弹道碎石术、输尿管狭窄扩张术、胃肠道良性肿物切除、食道狭窄支架置放、食道及胃底静脉曲张套扎治疗及组织胶封堵术、内镜下逆行胰胆管造影、腹腔镜阑尾切除手术、腹腔镜消化道穿孔修补术、腹腔镜胃癌根治术、腹腔镜结直肠癌根治术、腹腔镜脾脏切除手术、腹腔镜肠粘连松解术、胸腔镜肺楔形切除术、胸腔镜肺大疱切除术、胸腔镜肺叶切除+纵隔淋巴结清扫术、子宫全切除术、子宫次全切除术、子宫肌瘤剔除术、卵巢囊肿切除术。