医院设有呼吸内科、神经内科、肾内内分泌科、消化内科、心内科、肿瘤科、骨科、泌尿外科、普外科、神经外科、妇产科、儿科、儿保科、重症医学科（ICU）、NICU、感染科、急诊科、康复科、老年病科、麻醉科、门诊部、手术室、眼耳鼻喉科、中医科、CT-MRI室、病理室、超声科、放射科、检验科、健康管理（体检）中心、输血科、针灸理疗室等临床科室和医技科室。

会昌县重点学科：骨科、妇产科、神经外科、心血管内科、呼吸内科、感染性疾病科、儿科(含NICU)。

一、优势病种：妊娠合并心脏病、前置胎盘、胎盘早剥、重度子痫前期、高血压病、高血压性心脏病、冠心病(心绞痛、心肌梗死)、心律失常、心力衰竭、风湿性心脏瓣膜病、先天性心脏病、心肌炎、心肌病、高血脂、病毒性脑炎、小儿肠炎、肺炎、癫痫、肾病、哮喘、肾炎、尿毒症、糖尿病及糖尿病相关并发症、甲状腺相关疾病、骨质疏松、系统性红斑狼疮、风湿类风湿性关节炎、痛风、泌尿道感染、各种贫血、脑出血、脑梗塞、脑动脉硬化、脑供血不足、眩晕症、脑炎、癫痫（成人）、帕金森病、多发性硬化、神经痛。

二、优势技术：颈椎前路（含寰枢椎）手术、胸腰椎后路内固定术、微创经皮椎弓根钉内固定术、微创经皮椎体成形术、腰椎后路椎间融合术、微创椎间孔镜下腰椎间盘突出髓核摘除术、四肢骨折内固定术、腹腔镜下输卵管切除、异位妊娠病灶切除，卵巢囊肿剥除、子宫全切除术、子宫肌瘤剔除术、阴式子宫全切除术、老年性子宫脱垂阴道半闭合术、宫颈锥切术、子宫脱垂悬吊术、脑出血开颅显微镜下血肿清除及方体定向微创软通道手术、标准外伤去骨瓣减压术、颅内肿瘤切除术、脑积水脑室腹腔分流手术、颅内动脉瘤夹闭手术及介入栓塞治疗、腰椎间盘髓核摘除术、颈椎/腰椎椎管减压及内固定植骨术、椎管内肿瘤切除手术、胃肠镜消化道息肉电凝电切术、内镜下消化道异物切除术、消化道粘膜切除术、小肠营养管置入术、消化道出血内镜下治疗。