医院设有呼吸内科、心血管内科、消化内科、风湿科、肾内科、血液科、内分泌科、神经内科、肿瘤内科、干部病房、重症医学科、急诊科（综合内科）、中医科、儿内科、皮肤科、肛肠科、感染科、普外科、基本外科、肝胆外科、结直肠外科、胃外科、血管及甲状腺外科、乳腺外科、胸外科、心外科、泌尿外科、骨科、神经外科、妇产科、儿外科、急诊外科、烧伤科、整形外科、麻醉科（疼痛门诊）、耳鼻喉科、眼科、口腔科、激光美容室、介入科、放疗科、检验科、放射科、CT和MR室、核医学科、超声科、病理科、输血科、伽玛刀治疗室、药学部、抗凝咨询、营养科等临床科室和医技科室。

一、国家临床重点专科：血液内科、心脏大血管外科、普外科、烧伤外科、老年医学科、临床护理。

二、国家临床重点专科建设项目：烧伤科。

三、福建省临床重点专科：消化内科、血液内科、心血管内科、心脏外科、普外科、烧伤科、老年医学科。

四、福建省医学重点学科：肝胆外科。

五、福建省“211工程”重点学科：血液科。

六、福建省临床重点专科建设项目单位：烧伤科。

一、优势病种：慢性支气管炎、肺气肿、肺源性心脏病、支气管哮喘、消化道大出血、急性出血坏死性胰腺炎、肝硬化肝性脑病、严重败血症、休克、类风湿关节炎、系统性红斑狼疮、干燥综合征、强直性脊柱炎、原发性血管炎、糖尿病肾病、高血压肾损害、狼疮性肾炎、系统性血管炎肾损害、急/慢性白血病、恶性淋巴瘤、多发性骨髓瘤、骨髓增殖异常综合征（MDS）、癫痫、睡眠障碍、老年变性疾病、脑血管病、神经遗传变性病、神经免疫病、神经肌肉病、鼻咽癌、喉癌、甲状腺癌、舌癌、口腔癌、乳腺癌、食管癌、肺癌、纵隔肿瘤、恶性淋巴瘤、胰腺癌、直肠癌、肛门癌、阴道癌、卵巢癌、骨肉瘤、骨髓瘤、纤维肉瘤、尤文氏瘤、巨细胞瘤。

二、优势技术：序惯双球囊二尖瓣成形术、主动脉瓣成形术、肺动脉瓣成形术、导管冠脉内溶栓术、PTCA术、急性心肌梗死急诊介入手术、先天性心脏病导管介入手术、心脏再同步起搏术、冠状动脉斑块旋磨手术、心脏再同步起搏术、动静脉瘘导管栓塞术、中心静脉置管、自体动静脉内瘘成形术、腹膜透析置管术、腔静脉过滤器植入、导管溶栓治疗动静脉血栓、异位妊娠的介入治疗、足指移植拇再造、各种方式的腰椎间盘手术、关节镜手术、人工关节置换手术、听力康复手术、鼻内镜微创手术、鼻内镜下脑脊液鼻漏修补术、鼾症手术治疗、甲状腺肿瘤切除术、咽喉头颈肿瘤手术治疗、喉气管狭窄成形术。