医院设有中西医结合一科、中西医结合二科、食管纵隔肿瘤外科、肺肿瘤外科、乳腺科、胃肠肿瘤外科、肝胆肿瘤外科、神经外科、头颈肿瘤外科、妇科、肿瘤内科、血液肿瘤科、重症医学科（ICU）、泌尿肿瘤外科、介入科、检验科、病理科、超声影像科、麻醉科等临床科室和医技科室。

一、广东省重点专科：肿瘤科、医学影像科。

二、广州市中医重点专科：中西医结合科。

三、广州市重点扶持学科：肿瘤学。

四、医院重点学科：肺肿瘤外科。

五、医院重点临床科室：胃肠肿瘤外科。

一、优势病种：肺癌、食道癌、乳腺癌、鼻咽癌、子宫癌、肝癌、头颈肿瘤、胸部肿瘤、腹盆部肿瘤、淋巴瘤、血液肿瘤、化学性静脉炎、肺肿瘤、喷门癌、纵隔肿瘤、胸壁肿瘤、乳腺肿瘤、低位直肠癌、胃癌、子宫颈癌、子宫内膜癌、卵巢癌、子宫肉瘤、外阴癌、阴道癌、恶性滋养细胞肿瘤、子宫肌瘤、子宫内膜异位症、卵巢囊肿、膀胱癌、肾癌、阴茎癌、前列腺癌、睾丸肿瘤、肾盂输尿管癌。

二、优势技术：肿瘤热灌注治疗技术、肺癌综合诊治技术、腹腔镜经自然腔道取标本手术（NOSES）、腹腔镜胃与结直肠癌根治术、腹腔镜或小切口腔镜辅助下Habib4X肝转移癌切除技术、肝癌多模式微创序贯综合治疗技术、经鼻蝶入路垂体腺瘤切除术、B超引导下乳腺肿物麦默通微创旋切术、CT灌注成像技术、肺叶切除并系统性淋巴结清扫术、全肺切除术、袖状肺叶切除术、胸膜外全肺切除术、纵隔镜纵隔淋巴结活检术、经左胸食管癌根治术、经左胸贲门癌根治术。