医院设有心血管病一科、心血管病二科、心血管病三科、心血管病四科、呼吸科、血液病科、肾病科、肝脾胃病科、骨伤一科、骨伤二科、骨伤三科、骨伤四科、内分泌科、周围血管病科、癫痫诊疗中心、风湿病科、肿瘤科、外一科、外二科、外三科、肛肠科、妇科一科、妇科二科、产科、妇科门诊、儿一科、儿二科、眼科、耳鼻喉科、口腔科、皮肤科、推拿科、康复科、、治未病中心、针灸一科、针灸二科、针灸三科、针灸四科、针灸五科、重症医学科、急诊科、手术麻醉科、中医转化医学研究中心、检验科、同位素室、病理科、物理诊断科、超声医学科、放射线科、CT磁共振科、内镜诊疗科、输血科、消毒供应室、营养部、药学部等临床科室和医技科室。

一、国家临床重点专科：外科、血液病科、妇科、护理学专科。

二、国家级重点学科：中医妇科学、中医内科学。

三、国家中医药管理局重点专科：心血管科、内分泌科、血液病科、脾胃病科、皮肤科、妇科、耳鼻喉科、治未病科、护理学专科。

四、国家中医药管理局重点学科：中医妇科学、中医内科内分泌病学、中医内科心病学、中西医结合临床、中医皮肤病学、中医血液病学、中医眼科学。

五、黑龙江省重点专科：肾病科、肺病科、眼科、骨伤科、脑病科、针灸科。

六、黑龙江省教育厅重点学科：中医妇科学、中医内科学、中医骨伤科学、中西医结合临床、中医外科学。

七、黑龙江省中医药管理局重点学科：中医耳鼻喉学科、中西医结合神经内科学科、中西医结合肾病学科、中西医结合呼吸学科、中西医结合内分泌学科、中医皮肤学科。

八、校级重点学科：中西医结合临床神经内科学、中医外科学、医学影像与核医学、中医儿科学、中医护理学、中医络病学。

一、优势病种：月经病（多囊卵巢综合征）、不孕症（生殖道感染）、妇科肿瘤、胃肠炎性病变疾病、糖尿病、糖尿病下肢血管病变、糖尿病周围神经病变、代谢综合征胰岛素抵抗、甲状腺结节、甲亢、甲减、原发性醛固酮增多症、皮质醇增多症、代谢综合征、冠心病、心律失常、心肌炎、心脏神经官能症、高血压、再生障碍性贫血、血小板减少性紫癜、动脉硬化闭塞症、下肢深静脉血栓形成、慢性阻塞性肺疾病、支气管哮喘、湿疹、荨麻疹、过敏性紫癜、青光眼、眼肌麻痹、白内障、眼底病、腰间盘突出症、颈椎病、慢性骨髓炎、脊柱结核、骨折、慢性萎缩性胃炎、脂肪肝、肝硬化腹水、中风病、老年性痴呆、帕金森病、小儿肺炎及哮喘、厌食、积滞、腹泻、腹痛、便秘。

二、优势技术：中医药防治瞳神紧小（虹膜睫状体炎）、中医药防治消渴目病（糖尿病性视网膜病变）、中医药防治白涩症（干眼病）、中药注射液髋关节腔内注射治疗股骨头缺血性坏死及退行性膝关节病、人工全髋关节、全膝关节置换、针灸、乳腺癌改良根治术、胃癌根治术、结肠癌/直肠癌根治术、阑尾切除术、肠梗阻手术、门静脉高压症断流、微创甲状腺手术-甲状腺微波消融术、中药经穴离子导入、中药穴位敷贴、中药耳穴压籽、中药足浴、中药熏洗、中药雾化吸入、中药灌肠、拔罐疗法、封包疗法、穴位埋线疗法、中药溻渍治疗、耳穴压豆、至阳穴埋针。