医院设有消化内科、肾病内科、呼吸内科、血液病科、普内科、神经内一科、神经内二科（脑卒中病房）、心血管内一科、心血管内二科、耳鼻喉—头颈外科、普外一科（肝胆、小儿外科、胃肠）、普外二科（微创外科）、心血管外科、胸外科、神经外一科、神经外二科、泌尿外科、肿瘤外科、妇科、产科、儿科、中医科、急诊科、口腔科、眼科、骨一科、骨二科（创伤骨科、关节外科、手外科、小儿骨科、骨肿瘤）、骨三科（关节外科）、皮肤科、麻醉科、特需诊疗科、中心供应室、健康体检中心、病理科、放疗科、放射科、内窥镜、输血科、检验科、药剂科、超声科等临床科室和医技科室。

天水市临床重点专科：心血管内科、神经内科、骨科、泌尿外科、神经外科、肾病内科、胸心外科、呼吸内科、麻醉科、急诊科、超声科、产科、儿科、消化内科、耳鼻喉头颈外科。

一、优势病种：心律失常、先天性心脏、冠状动脉粥样硬化性心脏病、头痛、头晕、晕厥、癫痫、失眠、神经症、抽动秽语症、神经痛、面肌痉挛、恢复期脑血管病、颈椎病、腰椎间盘突出症、腰椎滑脱、椎管狭窄症、肾上腺肿瘤、肾癌、肾盂癌、输尿管口囊肿、膀胱结石、急/慢性肾功能衰竭、尿毒症、狼疮性肾炎、过敏性紫癜性肾炎、颅脑先天性疾病、颅内肿瘤、脑血管畸形、高血压脑出血、颅内血肿、颅骨骨折、高血压脑出血、脊膜膨出。

二、优势技术：冠状动脉造影、支架植入术、心律失常射频消融术、先天性心脏病封堵术、外周动脉支架植入术、呼吸肌麻痹的救治、气管切开护理、良性位置性眩晕手法复位治疗、中晚期结核性脑膜炎鞘内注药治疗、瘫痪患者床旁早期肢体康复/压疮/深静脉血栓防治、手术复位/减压/椎弓根螺钉内固定技术、脊柱结核先期强化抗痨、经腹腔镜下肾上腺肿瘤切除术、单纯肾肿瘤肾部分切除术（经腹腔镜下及开放手术）、肾癌/肾盂癌根治术（经腹腔镜下）、经腹腔镜下肾囊肿去顶减压术。