1885年，医院前身-妇婴专科医院由美国基督教长老会创建。

1917年，医院更名为道济医院。

1952年，医院更名为北京市第六医院。

1997年，医院被评定为二级甲等医院。

医院编制床位632张，开放560张，配有GE1.5T奥运核磁共振、西门子64排128层螺旋CT、飞利浦心脏血管造影机、飞利浦数字化医用X射线摄影系统、西门子全数字移动式C形臂X射线机、西门子数字活检乳腺X光机、德国耶格肺功能检测系统、美国伟康睡眠检测系统、全自动生化分析仪、彩色超声多普勒诊断仪、血液透析机、多功能监护仪、有创、无创呼吸机、电子胃肠镜、纤维支气管镜、鼻窦镜、腹腔镜、关节镜、阴道镜、宫腔镜、膀胱镜等医疗设施。

医院是北京市全科医师培训基地、北京国际针灸培训中心外籍学生的临床教学实习、河南南阳理工学院张仲景国医学院护理临床实习基地、北京市护士重新申请职业注册临床护理培训医院、北京市妇产医院大专班、北京市自学考试护理大专班。

医院设有神经内科、心血管内科、呼吸内科、消化内科、肾内科、血液肿瘤内科、内分泌科、免疫科、感染性疾病科、重症监护科、心脏重症监护科、普通外科、心外科、心胸血管外科、乳腺外科、泌尿外科、肿瘤外科、骨科、医学美容外科、妇科、产科、儿科、眼科、耳鼻喉科、口腔科、皮肤科、中医科、精神科、针灸推拿科、急诊科、理疗科、检验科、放射科、血液净化中心等临床和医技科室。

一、北京市东城区重点专科：心血管内科、骨科、普外科、神经内科、中医科、医学影像中心。

二、北京市综合医院示范中医科：中医科。 

一、优势病种：高血压、冠心病、风心病、心肌病、心律失常、心肌梗死、心力衰竭、髋关节/膝关节疾病、老年人髋部骨折、骨质疏松、脊柱疾病、关节运动性损伤、退行性骨关节疾病、胃食管反流病、胃十二指肠球部溃疡、腹水、缺血性肠病、溃疡性肠结炎、克隆氏病、肠结核、癫痫、焦虑抑郁状态、风湿病、糖尿病、糖尿病足、高血脂、肺部恶性肿瘤、脑血管病、记忆力减退与脑白质髓鞘病变、周围神经病、头晕、头痛、失眠、焦虑抑郁。

二、优势技术：冠状动脉造影及PCI介入治疗，冠状动脉钙化病变旋磨术、无痛内镜技术、镜下消化道早癌切除技术、镜下止血技术、ERCP胆管取石及胆管支架置入技术、消化道支架植入术、中药熏蒸、足浴、中频药物离子导入、腺体楔形切除术、巨乳症缩乳成形术、乳腺单纯切除术。