医院设有神经内科、心内科、呼吸内科、消化内科、肾病内科、内分泌科、风湿免疫科、肿瘤内科、血液内科、感染性疾病科、血液透析中心、老年医学科、普外科、神经外科、心胸血管外科、泌尿外科、介入血管科、骨科、运动关节科、烧伤整形科、妇科、产科、儿科、眼科、耳鼻喉科、口腔科、皮肤科、康复医学科、急诊科、重症医学科、麻醉疼痛科、全科医学科、中医针灸科、体检中心、临床营养科、放疗科、核医学科、检验中心、超声科、动态心电图室、B超室、心电图室、脑电图室、手术室、药剂科等临床和医技科室。

一、国家重点学科：内科学（心血管病）。

二、国家临床重点专科：心脏大血管外科。

三、江苏省专科（病）诊疗中心：江苏省冠心病诊疗中心。

四、江苏省临床重点专科：心胸血管外科、心血管内科、内分泌科、核医学科、产科、药学部、消化内科、肾脏内科、康复医学科、呼吸内科、神经内科、重症医学科、肿瘤科、医学检验科、普外科、泌尿外科、麻醉科、急诊医学科、骨科、放射影像科。

五、南京市医学重点专科：风湿免疫科、神经外科、儿科、妇产科、感染性疾病科、口腔科、眼科、血液科。

一、优势病种：心力衰竭、心律失常、冠心病、高血压、心肌病、急性心肌梗塞、不稳定性心绞痛、高脂血症、难治性产科出血、凶险性前置胎盘、羊水栓塞、妊娠合并急性脂肪肝、妊娠合并免疫系统疾病、胆总管结石、胆道梗阻、胰腺占位、急性重症胰腺炎、急慢性肾小球疾病、急性肾损伤、难治性肾病综合征、复杂性尿路感染及自身免疫性肾病、上呼吸道感染、肺部感染、慢性咳嗽、慢性阻塞性肺病、肺部小结节、肺部肿瘤、支气管哮喘、胸腔积液、帕金森病、癫痫、脑血管病、神经脱髓鞘疾病、头疼、脊髓病、癫痫、高血压、高血脂、脑卒中、肺癌、乳腺癌、淋巴瘤、消化道肿瘤、精原细胞瘤、头颈部恶性肿瘤、糖尿病、甲状腺、肾上腺、性腺、垂体疾病、痛风、血脂异常、骨代谢异常、泌尿系统肿瘤、泌尿系结石及前列腺疾病、复杂关节脊柱畸形、肿瘤、髋膝骨性关节炎、骨折。

二、优势技术：各种先天性心脏病的矫治手术、各种心脏瓣膜置换和成型手术、微创心脏搭桥、心脏移植、主动脉瘤和主动脉夹层的急症手术(全弓置换+支架象鼻)、重症心脏多瓣膜手术、梗阻性肥厚性心肌病手术、迷宫手术治疗房颤、ECMO心肺支持、经皮冠状动脉介入(PCI)治疗术、骨髓间充质干细胞心肌内移植术、心脏自动导航系统存活心肌检测技术、经皮化学消蚀术治疗肥厚梗阻型心肌病、射频消融术、经皮先天性心脏病介入治疗术、多腔起搏技术（CRT及CRT-D）、自动复律除颤起搏器植入术（ICD）、经皮主动脉腔内隔绝术治疗急性主动脉夹层、超声内镜下神经节阻断术、食管胃底静脉曲张硬化、套扎治疗术、内镜下光动力治疗、内镜下经皮胃造瘘术、内镜下消化道支架治疗消化道良恶性狭窄及贲门失弛缓、静脉溶栓、动脉溶栓、静动脉联合溶栓、MRI指导下溶栓治疗、肿瘤常规化疗、抗肿瘤血管治疗、肿瘤生物治疗、中医药治疗、镇痛支持治疗、分子靶向治疗、肿瘤放射治疗、肿瘤微创治疗、前列腺绿激光汽化切除、前列腺电切术、腹腔镜外科技术、腹腔镜前列腺癌根治、肾癌保留肾单位手术、膀胱癌全膀胱切除术、人工全髋/全膝关节置换。