医院设有蒙医五疗脑病科、蒙医五疗/康复科、蒙医脾胃病科、蒙医心身医学科、蒙医血液病科、蒙医脑病科、蒙医骨伤科、蒙医心脏病科、蒙医皮肤科、蒙医妇科、蒙医儿科、蒙医肿瘤科、蒙医包氏正骨科、蒙医针推科、蒙医内分泌科、蒙医风湿病科、蒙医传统正骨科、蒙医布病·关节病科、蒙医传统内疗科、蒙医肺病科、神经内科、心血管内科、心脏病二科、呼吸内科、蒙医肾病科、西医内分泌科、蒙医甲状腺病专科、蒙医消化二科、脑外科、胸外肿瘤科、心胸外科、肛肠科、泌尿外科、血管外科、烧伤整形科、普外科、眼科、耳鼻喉科、口腔科、蒙医老年病科、蒙医点穴反射疗法科、知名专家门诊、全科医疗科、手术麻醉科、蒙医五疗药浴中心、血液透析室、急诊与重症医学科、骨外科、蒙医贴敷门诊、蒙医整骨科、双心门诊、健康体检中心、蒙药制剂中心、重症医学科、临床检验中心、功能检查科、影像中心、药学部、病理科、供应室等临床科室和医技科室。

一、国家临床重点专科：蒙医五疗科、蒙医康复科、蒙医萨病科、蒙医护理学、蒙医脾胃病科、蒙医心身医学科。

二、国家中医药管理局重点学科：蒙医血液科、蒙医五疗萨病科、蒙医脑病科、蒙医心身医学科。

三、国家中医药管理局重点专科：蒙医五疗科、蒙医康复科、蒙医萨病科、蒙医心血管科、蒙医骨伤科、蒙医皮肤病科、蒙医脾胃病科、临床蒙药学、蒙医护理学、蒙医心身医学科。

四、内蒙古自治区重点学科：蒙医临床护理学、蒙医血液病学。

五、自治区领先学科：蒙医包氏整骨科、蒙医儿科、蒙医妇科、蒙医肝胆病科、蒙医骨伤科、蒙医康复科、蒙医疗术科、蒙医脑病科、蒙医脾胃病科、蒙医心身医学科、蒙医心脏病科、蒙医肿瘤病科、蒙西医皮肤病科。

六、内蒙古自治区特色重点专科：蒙医儿科、蒙医肿瘤内科、蒙医血液科、蒙医风湿病科、蒙医内疗科、蒙医肝胆消化科、蒙医妇科、蒙医内分泌科、蒙医传统整骨科、蒙医针推科、蒙医布鲁氏菌病科。

一、优势病种：抑郁、癫痫、面神经麻痹、脱髓鞘疾病、过敏性紫癜、血小板减少症、脑血管病、脑外伤、脑瘫、骨髓异常增生综合症、慢性粒细胞性白血病、反流性食管炎、慢性胃炎、急慢性胆囊炎、病毒性肝炎、冠心病心绞痛、心力衰竭、心肌炎、骨结核、骨肿瘤、骨关节畸形、脑出血、脑梗死、银屑病、白癜风、甲状腺功能亢进、肠道恶性肿瘤、乳腺恶性肿瘤、糖尿病性周围血管病变、尿道下裂、隐睾。

二、优势技术：蒙医火针、温针、放血、蒙医震脑术、蒙医熏蒸、蒙医整骨术、包金良整骨、蒙医点穴反射疗法、蒙医推拿复位、烙铁点穴、蒙医头皮针、蒙医茶疗术、蒙医小儿脑瘫康复、蒙医铜罐、蒙医擀背疗法、蒙医策格疗法、锤震疗法、蒙医五疗药浴、关节镜下关节韧带重建、游离体摘除。