医院设有心血管内科、呼吸内科、消化内科、血液内科、肾内科、神经内科、老年病科、内分泌科、风湿科、胃肠疝外科、甲状腺乳腺外科、创伤外科、脊柱外科、关节外科、肝胆胰外科、泌尿外科、神经外科、心胸外科、全科医学科、重症医学科、急诊科、妇科、产科、儿科、耳鼻咽喉头颈外科、眼科、口腔科、肿瘤科、生殖医学科、中医科、康复医学科、皮肤科、烧伤整形科、口腔颌面外科、麻醉科、医学影像科、药剂科、检验科、体检科、病理科、介入科、输血科、放射科、超声科、核医学科等临床和医技科室。

一、江西省临床重点专科：胃肠疝外科、神经外科、中医科。

二、江西省省市共建学科：心血管内二科、呼吸内科、消化内科、神经内科、神经外科、麻醉科。

三、赣州市重点学科：胃肠疝外科、妇科、急诊科。

四、赣州市重点专科：心血管内二科、泌尿外科。

五、院重点科室：心血管内一科。

一、优势病种：急性心肌梗死、心源性休克、顽固性心衰、恶性心律失常、高血压危象、瓣膜病、心肌病、重症哮喘、睡眠呼吸障碍等疾病、肺间质疾病、肺癌、消化道大出血，重症急性胰腺炎、肝硬化顽固性腹水、脂肪肝、酒精肝、慢性肝炎、肝癌、癫痫、帕金森病。

二、优势技术：胃肠道肿瘤根治术、低位直肠癌保肛手术、腹腔镜疝修补术、痔上黏膜环切术、经桡动脉复杂冠状动脉介入术、各种器械植入、各种复杂心律失常的射频消融、结构性心脏病的介入、良恶性食道及贲门狭窄梗阻的扩张及支架置入、结肠梗阻支架置入、胃肠息肉切除、腹腔镜下行广泛性全子宫切除术、盆腔淋巴结清扫术、传统盆底手术及网片及吊带盆底功能修复术、阴式子宫切除术。