医院设有内科、外一科、外二科、妇产科、儿科、眼耳鼻咽喉科、口腔科、皮肤科、急诊科、中医骨伤康复医学科、中医科、麻醉科、病理科、医学检验科、医学影像科、体检中心等临床科室和医技科室。

一、四川省重点专科：皮肤科。

二、雅安市重点专科：中医骨伤康复医学科、医学影像科。

三、医院特色专科：眼耳鼻喉科、妇产科（产科专业）、外一科（泌尿专业、小儿外科专业、难愈创面）、内科（呼吸、消化专业）、口腔科、儿科。

一、优势病种：嵌甲、皮肤浅表赘生物、睑黄瘤、鳞状细胞癌、基底细胞癌、恶性黑色素瘤、性病、中风偏瘫、截瘫、工伤、骨折术后、周围神经损伤、断肢再植术后、心肺疾病、颈椎病、腰椎间盘突出症、骨质疏松症、骨关节炎、痛风性关节炎、风湿/类风湿关节炎、成人股骨头缺血坏死、急慢性软组织损伤、结缔组织病、小儿脑瘫、儿童自闭症谱系障碍、儿童智力残疾、鼻窦炎、小儿、成人鼾症或睡眠呼吸暂停低通气综合征（OSAHS）、耳鼻咽喉及头颈部先天性鳃裂囊肿及瘘管、甲状舌管囊肿及瘘管、中耳炎及鼓室成形、耳鸣、耳聋、喉癌及头颈部肿瘤、鼻咽部肿瘤、炎症、肿瘤、月经失调、子宫内膜异位症、围绝经期综合症、不孕、小儿斜疝、脐疝。

二、优势技术：子宫次全切除术、全切除术、肌瘤挖除术、子宫修复整形术、卵巢肿瘤剥除术、卵巢肿瘤切除术、附件切除术、卵巢修复整形术、输卵管切除术、切开取胚术、修复整形术、吻合术、卵巢、子宫/宫颈癌常规手术、宫颈LEEP刀环/锥切、处女膜修补术、前庭大腺相关手术、阴道缩窄术及修补术、会阴撕伤修补术、剖腹产手术、胰头癌及胆管下段癌切除术、胰腺体尾部肿瘤切除术、脾脏肿瘤切除术、胃癌根治术、结直肠癌根治术、经腹腔镜胆囊切除术、经腹腔镜胆总管探查取石术、经腹腔镜阑尾切除术、经腹腔镜肝囊肿及肾囊肿切除术、经尿道膀胱镜检查、经尿道前列腺等离子电切术、经尿道膀胱肿瘤切除术、尿道狭窄修复术、经腹前列腺切除术、膀胱部分切除术、肾脏肿瘤切除术、肾盂切开取石术、输尿管切开取石术、输尿管狭窄修复术、体外超声波碎石治疗。