医院设有肾内科、肿瘤科、血液内科、呼吸内科、消化内科、内分泌科、风湿免疫科、神经内科、心血管内科、泌尿外科、神经外科、胸心血管外科、耳鼻喉头颈外科、骨科、肝胆腺体外科、妇科、产科、儿科、新生儿科、眼科、口腔科、麻醉科、输血科、体检科、放射科、超声科、病理科、高压氧科等临床和医技科室。

一、广西壮族自治区临床重点专科：肾内科、重症医学科、神经内科、临床护理、骨科、血液内科、医学检验科。

二、广西壮族自治区医疗卫生重点学科：心血管内科、急诊医学科。

三、广西壮族自治区医疗卫生重点培育学科：呼吸与危重症学科。

四、广西壮族自治区妇幼健康重点学科：儿内科、产科。

五、南宁市重点学科：呼吸内科、心血管疾病诊疗中心、神经外科、医学检验科、超声医学科、麻醉科。

六、南宁市临床特色专科：骨与软组织肿瘤专科、全科医学科。

一、优势病种：肺部感染性疾病、慢性阻塞性肺疾病（COPD）、支气管哮喘、呼吸危重症、胸膜疾病、肺血管疾病、肺部肿瘤、睡眠呼吸障碍、上消化道大出血、重症胰腺炎、肝硬化肝昏迷、消化性溃疡、慢性胃炎、胆囊炎、胆结石、胃食管反流病、慢性结肠炎、感染性肠病、消化道肿瘤、脑血管疾病、中枢神经系统感染、中枢神经系统脱髓鞘疾病、帕金森氏病、急性中毒性脑病、周围神经病、癫痫、各种类型头痛、眩晕、大面积脑梗死、脑出血、蛛网膜下腔出血、急性脊髓炎、休克、重症肺炎、重症胰腺炎、严重多发伤、脓毒症、臂丛神经损伤修复。

二、优势技术：拇指再造、外固定支架矫形治疗四肢骨关节畸形技术、人工髋关节膝关节置换术、肢体短缩骨延长术、关节镜下膝关节半月板损伤术、交叉韧带损伤重建术、股骨头坏死经皮微创病灶清除加植骨术。