医院设神经内科、心血管内科、内分泌科、呼吸内科、急诊与重症医学科、消化肾病科、脑病科、血液肿瘤科、神经外科、胸心外科、泌尿外科、普外科、血管介入外科、蒙医脑血管介入科、骨关节外科、手足外科、蒙医外科、消化科、西医骨科、骨伤科、骨病科、肿瘤科、肾病科、精神医学科、传统整骨科、中医科、风湿免疫科、蒙医心病科、蒙医妇科、西医妇科、蒙医儿科、西医儿科、西医眼科、蒙西医结合眼科、耳鼻喉科、口腔科、皮肤科、男性科、肛肠科、血透室、西药剂部、麻醉科、疗术中心等临床与医技科室。

一、国家临床重点专科：蒙医血液科、脑病专科、蒙医传统疗术科。

二、国家中医药管理局重点专科：蒙医血液科、脑病专科、蒙医传统疗术、蒙医心病科、临床蒙药。

三、内蒙古自治区重点学科：蒙医血液科、脑病科、蒙医心病科。

四、内蒙古自治区特色优势专科：蒙医传统整骨科、骨病科、肺病科、蒙医外科。

五、通辽市医学领先学科：蒙医脑病科、蒙医骨伤科、蒙药临床药理实验室、妇产科、心血管内科、医学影像。

六、通辽市医学重点学科：呼吸内科、内分泌科、神经内科、普外科、胸外科、眼科、麻醉科、中医科、蒙医呼吸内科、蒙医风湿病学。

一、优势病种：过敏性紫癜、紫癜性肾炎、各种血小板减少症、白血病、再生障碍性贫血、骨髓增生异常综合症（MDS）、真性红细胞增多症、淋巴瘤、骨髓瘤、各种贫血、乳腺癌、胃癌、食道癌、结肠癌、直肠癌、肺癌、肝癌、卵巢癌、子宫癌、肾癌、头颈部癌、脑出血、蛛网膜下腔出血、脑梗死、脑栓塞、脑膜脑炎、脊髓疾病、格林巴利、重症肌无力、运动神经元病、周期性麻痹、老年变性病、癫痫、脑囊虫病、头痛、失眠症、焦虑抑郁症、周围神经病变、高血压脑病、偏瘫康复、眩晕症、肩周炎、强直性脊柱炎、类风湿性关节炎、风湿寒痛症、软组织损伤、失眠症、面瘫、顽固性呃逆、各类疼痛、神经血管性头痛、脑血管后遗症、忧郁症、强迫症、慢性疲劳综合症、帕金森病。

二、优势技术：放血疗法、拔罐放血疗法、灸疗法、温针疗法、推拿、震脑术、贴敷疗、尼如哈疗法、灸疗法治疗心悸症（心血管神经症）、敷疗法治疗赫依性心刺痛、蒙药足浴法治疗慢性心衰。