《Scientific reports》：研究开发了一种便携式现场适用的mNGS方法

　　近日，一组来自比利时的研究团队在杂志Scientific reports上发表了一篇题为“Development of a portable on-site applicable metagenomic data generation workflow for enhanced pathogen and antimicrobial resistance surveillance”的文章。在本研究中，作者将重点放在湿实验室方面，结合Claremont Bio OmnilyseX、Bento Bio Pro和VolTRAX设备开发了一种便携式现场适用的mNGS方法。为了优化数据生成方法，作者使用鸡粪样本作为测试案例，因为家禽肠道微生物组已被证明含有多种抗生素耐药基因ARGs。作者逐步改进并最终建立了一个湿实验室流程，可产生高质量的纳米孔mNGS数据。并使用spike-in的模拟群落，作者将分类和抗性组分析性能与其他测序工作流程进行了比较。