新的基因检测技术提高了临床生物标志物的分析准确性

爱沙尼亚科学家宣布发明基因检测技术，可以在单分子水平上分析临床生物标志物的数量，从而提高精准医学检测的灵敏度，使其在未来更加经济。正在申请专利的TAC-seq方法已用于生育诊所，以确定月经周期中适当胚胎移植的个体差异。

这种名为TAC-seq的新分子工程方法提高了生物标志物分析的准确性，并有望使其更加经济。这种正在申请专利的方法将于明年以子宫内膜容受性测试的形式引入医疗保健系统，商标为beREADY test。

健康技术能力中心的爱沙尼亚研究人员与芬兰赫尔辛基大学塔尔图大学和瑞典卡罗林斯卡医学院合作，在《自然》合作期刊《基因组医学》上发表了一篇文章，作者在文章中通过测序展示了靶向等位基因计数(TAC-seq)和几种潜在的应用。该方法高精度地测量临床样本中用作生物标志物的DNA和RNA分子的数量，从而描述患者的健康状况。

生物标记可以是任何分子，其存在或不存在是可测量的，并且提供关于健康状态的信息。诊所使用数以千计的基于生物标志物的测试，其中许多分析了作为遗传和基因表达谱的代理的脱氧核糖核酸。我们必须尽可能准确地对临床测试做出反应，并将测试定价在合理的水平。

塔尔图生物信息学大学博士生Hindrek Teder认为，新方法是极其准确地分析反映患者实际情况的关键。“通常，在临床样本中，必须使用PCR方法扩增DNA，以确保下一代测序所需的材料，否则仪器无法测量。我们不知道一个给定的原始分子产生了多少拷贝，所以结果是不准确的。另一方面，使用TAC-seq，我们可以看到原始数据中没有信息丢失，并识别和删除实验室中制作的所有人工副本。结果是，校正后的生物标志物值反映了临床样本的最大可靠性。”

本文介绍了这种方法的三种可能的应用。首先，TAC-seq可用于子宫内膜容受性试验——测定特定RNA分子的水平，以确定将胚胎移植给接受不孕治疗的女性的最佳时间，从而增加体外受精成功的可能性。其次，可用于无创产前基因检测(NIPT)，研究女性血液中的无细胞DNA，检测胎儿最常见的染色体疾病。第三，该方法可用于不同体液中MicroRNA的精确分析。这些分子可以作为几种疾病的生物标志物，从而不再需要令人不快和痛苦的活检。

“在实验室分析生物标志物的过程中，每个独特的分子都会得到一个所谓的分子条形码。具有相似编码的分子——在实验室通过聚合酶链反应扩增制成的拷贝——被发现并融合在一起。这使得在实验室放大材料时可能发生的技术偏差最小化成为可能。到目前为止，分子条形码已经被用于研究，但现在它已经成为临床样本分析的标准，”泰德说，他也是第一作者。本文由塔尔图大学分子与细胞生物学博士生Mariann Koel和信息学硕士研究生Priit Paluoja共同完成。

研究负责人、卫生技术能力中心主要研究员kaarelkrjutskov博士指出，TAC-seq方法最初是经过多年实验实现的梦想。“有很多科学和高科技的基因分析方法用于研究患者，但我们发现迫切需要一种超精确且价格合理的解决方案。本质上，TAC-seq是一个不断拓宽的基因技术发明。在实践中，子宫内膜容受性试验已经在临床上得到验证。在该试验中，分析了子宫内膜的57个关键生物标志物，这提供了将试管婴儿胚胎移植给女性等待的最佳日期的指示。怀孕了。”

“作为一项开发活动，TAC-seq已接近理想课程。首先，我们进行了彻底的基础研究，然后我们申请了国际专利。现在我们已经公布了我们的成果，描述了这种方法在各个方面的应用，最重要的是——这种方法已经融入了医疗保健系统，”krjutskov总结了漫长的发展过程。